忍者世界中，有四项基本戒律：不准滥用忍术（只能用在公事上）、舍弃一切自尊（逃命要紧）、必须守口如瓶（即便为此失去性命）、绝对不能泄露身份（这是最基本忍术）。忍者活跃的时代，大致有三：十一世纪末至十二世纪末的源平时代、十三世纪的南北朝时代、十四世纪中旬至十五世纪末的战国时代。而战国时代也可以说是忍者“百花齐放，百家争鸣”的时代。
为了蒙混国境关卡守关人员的审问，忍者在旅途中，通常是农夫打扮。因此，所谓的忍者暗器，往往是改造自农具、日常必需用品、园丁道具等。这些武器，大多是自己发明铸造，只有自己深知其用法，因而在旁人眼里看来，跟一般日用品没什么分别。这也是忍者武器失传的主要原因之一。
现代人从各种忍术秘本中，所得知的忍术武器有：『手里剑』（syuriken）（或 shuriken）、『撒菱』（makibisi）、『忍刀』（shinobigatana）、『吹矢』（hukiya）、『忍杖』（sikomidue）、『手甲钩』（tekkoukagi）、『水蜘蛛』（mizugumo）、弓箭（bow）、『苦无』、『闻金』、『坪锥』、『问外』等。
『手里剑』类似我国武林中的飞镖，十码之内可百发百中。一般有八方手里剑、六角手里剑、十字手里剑、三角手里剑以及“卍”字型手里剑，这些手里剑掷出去后，在空中会围绕其几何中心旋转，因此轨迹稳定，在近距离能够保证一定的精度。多角型手里剑主要依靠锐利的角杀伤敌人，杀伤力有限，所以忍者会在每个角上都涂上剧毒，是很危险的武器。手里剑的重量在40克至60克间，一般忍者也不会携带几十枚，毕竟身轻如燕是他们的优势嘛。
『撒菱』，又称十字钉，是逃走时撒在身后的一种菱形武器；凡是凹凸不平，能够刺伤双足的东西，例如天然石头、干燥果实、铁器等，都可以拿来代用。
『忍刀』，很钝，附有一条长约三公尺的绳子，翻越城墙时，可以当踏脚工具，再利用绳子收回；刀鞘，临危时可以当潜在水中的通气管。
『吹矢』，就是毒针，通常藏在笛子内；有时候旅途中必需扮装成艺人，因此，忍者除了必须学吹矢手法，还得练习吹笛技术。
『忍杖』，是一种以弱制强的武器，先把竹子用油处理过，两头包铜，打击对手的穴道，减低对手的攻击能力和战斗意志，中间还可以藏一些武器，如链子、长矛等。
『手甲钩』，各式各样，有装在指甲上的，有套在手背上的，就看当事者擅长哪种功夫，自己变把戏。
『水蜘蛛』，渡河时用的道具，平时可以叠起来藏在包裹内。
『弓箭』，忍者使用的弓分为大弓和小弓两种。大弓用于远射，小弓用于近射。除射箭外，还能射火箭、响箭、开花箭（一种能爆裂作响的箭）等用来骚扰敌人。现代忍者有了手枪，弓箭就显得累赘不便。只有一种吹弩沿用至今。吹弩的吹管里藏有钢针，用力一吹，钢针便发射出去，但发射距离仅两三米。箭头经常喂有毒药，也是为了更有效的打击敌人，并且女忍者更是弓箭使用的专家。
『苦无』，这种叫苦无的工具长18厘米，对它的解释有两种：一、是种爬墙的工具，因为有时候忍者需要贴在墙上进行任务，绳钩就显得有些不太方便了，用几把苦无配合着就可以插入墙壁用脚踩着用手拉着，末端的环里可以栓绳方便收回。
二、是日本忍者所使用的一种暗器，有横劈、竖砍、斜斩、直刺、飞射五种基本使用方法，指手里剑，暗器的一种。
『闻金』，闻金，其实就是古代的窃听器，一端插入墙壁，因为金比较软，能够和沙砾等墙缝中的物质结合紧密，再把耳朵放在闻金上，就可以听屋中人的说话。那钢丝是干什么的呢？那就要高手用了，高手用钢丝把这块闻金和另一块插在安静处的闻金连起来，可以在远方把耳朵凑在那块闻金上听到屋中的声音！ 据说下面四分之一的部分要用纯金制成最好，后面的钢丝线是必要的时候连接另一块闻金的，但是，使用的时候线必须绷得很紧……
『坪锥』，日本以前的房子大多是木质的，这个东西是木头的刮削器。用那个U形的刀刃来刮削木头。至于作用嘛，是用于在木板墙上开孔窥视的。
『问外』，长18厘米，头上的弯曲4厘米，是拿在手里多在暗处拨门栓窗户这类东西的。前头有个弯是为了方便，我们用的播火的通条不也是很少有直的嘛。这个弯和通条前面的那个弯是一样的道理。
五行遁术——金木水火土
金遁术：就是用亮金属反射光线伤害对方眼睛，借此逃脱。
木遁术：日本的天狗足的祖先，主要利用攀爬和跳跃，借助一些工具逃脱。木遁的来源是在练习时一般是在树木上练习，以前房子地势低矮，能上树者基本能潜入任何宅院。
水遁术：培养水性，利用管子做水下呼吸，用特制木头鞋子（水蜘蛛）过河等。
火遁术：利用化学方式做成烟雾弹，或一些放火的道具，以前并没有炸弹出现，所以火遁的火器停留在原始的烟火上。
土遁术：不是像电影里钻到地里逃跑的那种，其实就是用来挖地道、挖些陷阱什么的。以前大部分为土地，地质较软容易实行。学此术的人会根据土的性质来挖地道或地洞进行隐藏。
在汉朝后期由于战争不断，遁术就此而生，主要用于躲避兵马之乱。
传说中的忍者
百地三太夫，又名百地丹波。是一个以伊贺上野为驻点的土豪、乃伊贺上忍三大家之一。在鬼瘤砦击退了织田信雄的伊贺平定军。终身与织田家抗战到底的传奇式忍者。
石川五右卫门，伊贺忍者。作为百地三太夫的部下，曾经潜入大坂城想刺杀丰臣秀吉。可惜由于不慎触动宝物“千鸟的香炉”而被发现，后被丰臣秀吉处死。
风魔小太郎，相州乱波的首领。侍奉了北条家五代家主。为北条家收集战时情报和进行破坏敌国的活动。传说风魔小太郎身高七尺二寸，据说在北条家灭亡后在江户城组织盗贼集团。他所率领的“风魔党”是活跃于黑道上的忍者集团，在日本民间流传着甚多的传说。
铃木佐大夫，杂贺众的头领。杂贺众是一个以铁炮（火枪）作为主要武器的佣兵集团。由于当时铁炮珍贵，所以杂贺众的战力自然不容忽视。与本愿寺勾结抗击织田信长。后来在与丰臣秀吉的战斗中被杀。
